Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pacsin3Q99JB8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms