Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sf3b5Q923D4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sf3b5Q923D4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sf3b5Q923D4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sf3b5Q923D4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b5Q923D4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Sf3b5Q923D4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sf3b5Q923D4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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