Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Afg3l1Q920A7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Afg3l1Q920A7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms