Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhbdd2Q8VEK2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms