Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GcaQ8VC88 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GcaQ8VC88 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms