Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TxlnbQ8VBT1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms