Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc12Q8R344 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc12Q8R344 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms