Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34c1Q8K193 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms