Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbsnQ8CIT9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms