Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Nhlrc3Q8CCH2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Nhlrc3Q8CCH2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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