Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF3

Gm10295, Predicted gene 10295, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10295Q8CCF3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm10295Q8CCF3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10295Q8CCF3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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