Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacnb2Q8CC27 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacnb2Q8CC27 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms