Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IfneQ80ZF2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms