Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrfn4Q80XU8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrfn4Q80XU8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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