Protein–RNA interactions for Protein: Q80V63

Prdm4, PR domain zinc finger protein 4, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm4Q80V63 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prdm4Q80V63 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prdm4Q80V63 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prdm4Q80V63 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prdm4Q80V63 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prdm4Q80V63 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm4Q80V63 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Prdm4Q80V63 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Prdm4Q80V63 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prdm4Q80V63 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm4Q80V63 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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