Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms