Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf8Q80TJ7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf8Q80TJ7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms