Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Dsg1cQ7TSF0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms