Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nphp3Q7TNH6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms