Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Scn4bQ7M729 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn4bQ7M729 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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