Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Lrrn2Q6PHP6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lrrn2Q6PHP6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lrrn2Q6PHP6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lrrn2Q6PHP6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lrrn2Q6PHP6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lrrn2Q6PHP6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms