Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6PD19 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q6PD19 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q6PD19 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q6PD19 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q6PD19 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6PD19 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6PD19 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6PD19 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6PD19 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms