Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HelbQ6NVF4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms