Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms