Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Arhgap20Q6IFT4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arhgap20Q6IFT4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms