Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp7Q6A4J8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp7Q6A4J8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp7Q6A4J8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp7Q6A4J8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp7Q6A4J8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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