Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sdc3Q64519 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sdc3Q64519 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sdc3Q64519 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sdc3Q64519 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc3Q64519 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sdc3Q64519 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc3Q64519 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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