Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprdQ64487 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms