Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Surf4Q64310 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms