Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vat1Q62465 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vat1Q62465 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vat1Q62465 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vat1Q62465 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Vat1Q62465 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vat1Q62465 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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