Protein–RNA interactions for Protein: Q60775

Elf1, ETS-related transcription factor Elf-1, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf1Q60775 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Elf1Q60775 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms