Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpn1lQ5XFR0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms