Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8M2

Odf3b, Outer dense fiber protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3bQ5M8M2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Odf3bQ5M8M2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms