Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lin28bQ45KJ6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lin28bQ45KJ6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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