Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc114Q3UX62 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms