Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
E130208F15RikQ3UPV3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E130208F15RikQ3UPV3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms