Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
InipQ3TXT3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms