Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spata18Q0P557 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spata18Q0P557 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms