Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calb2Q08331 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calb2Q08331 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calb2Q08331 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calb2Q08331 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calb2Q08331 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calb2Q08331 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calb2Q08331 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calb2Q08331 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calb2Q08331 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calb2Q08331 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calb2Q08331 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Calb2Q08331 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms