Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MestQ07646 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MestQ07646 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MestQ07646 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MestQ07646 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms