Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn3Q07409 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntn3Q07409 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms