Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox13Q04891 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms