Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1sQ02789 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1sQ02789 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms