Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col1a2Q01149 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms