Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SelpQ01102 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms