Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apoa1Q00623 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms