Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhbdl3P58873 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms