Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bace1P56818 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bace1P56818 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms