Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp5P56399 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms