Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcanP55066 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcanP55066 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcanP55066 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcanP55066 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcanP55066 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcanP55066 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NcanP55066 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NcanP55066 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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